赛默飞离子阱质谱它是由环行电极和上、下两个端盖电极构成的三维四极场。
原理：将离子储存在阱里，然后改变电场按不同质荷比将离子推出阱外进行检测。
赛默飞离子阱质谱的工作原理：
离子阱由一对环形电极和两个呈双曲面形的端盖电极组成。
在环形电极上加射频电压或再加直流电压，上下两个端盖电极接地。
逐渐增大射频电压的高值，离子进入不稳定区，由端盖极上的小孔排出。
因此，当射频电压的高值逐渐增高时，质荷比从小到大的离子逐次排除并被记录而获得质谱图。
离子阱质谱可以很方便地进行多级质谱分析，对于物质结构的鉴定非常有用。
赛默飞离子阱质谱主要应用：
1.赛默飞离子阱质谱应对代谢物鉴定和确证，可自动查找到所有可能的代谢物。
2.赛默飞离子阱质谱应对蛋白质组学和生物标记问题，ETD解离技术使LTQ XL成为蛋白质组学研究较大的分析工具。
3.赛默飞离子阱质谱是实现此技术的zui仪器。
ETD与CID互为补充，提高蛋白序列覆盖率；保护不稳定PTM翻译后修饰基团，简化数据分析；单次进样自动启动CID和ETD。
4.赛默飞离子阱质谱母离子智能选择：自动数据依赖多级质谱采集技术不仅能为用户提供预测代谢物结构信息，也能提供提供未预测的代谢物结构信息。
此外，使用自动固定中性丢失数据依赖性扫描触发3级质谱扫描能检测某一类的代谢物。
使用MetWorks和MassFrontier分析软件增强复杂基质钟代谢物筛选和鉴别功能，使谱图解析简便。
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